Для чего проводится исследование:

1. Установление молекулярно-генетического диагноза у пациентов со сложной, атипичной или неясной клинической картиной, когда предыдущие таргетные генетические тесты не дали результата («диагностический оддиссеей»).

2. Дифференциальная диагностика генетически гетерогенных заболеваний, когда один фенотип (симптомы) может быть вызван мутациями в десятках различных генов (например, наследственные нейропатии, миопатии, эпилепсии, умственная отсталость, нарушения слуха/зрения).

3. Выявление генетической причины множественных врожденных пороков развития или синдромальной патологии.

4. Планирование семьи (в комбинации с анализом родителей – «трио-экзом»): определение типа наследования, оценка риска повторения заболевания у будущих детей, возможность проведения преимплантационного генетического тестирования (ПГТ).

5. Выявление потенциальных терапевтических мишеней или предикторов ответа на лечение (прецизионная медицина).

Показания к назначению:

• Пациенты с неустановленным диагнозом после проведения базовых и специализированных обследований.

• Подозрение на редкое наследственное моногенное заболевание с нетипичными проявлениями.

• Синдромальная патология: сочетание множественных аномалий развития, неврологических нарушений, дисморфических черт, задержки психомоторного развития.

• Случай, когда фенотип предполагает мутацию в одном из многих генов (например, наследственная спастическая параплегия, синдром Марфана/марфаноподобная внешность).

• Бесплодие неясного генеза или множественные неудачные попытки ЭКО.

• Перинатальная летальность с подозрением на генетическую патологию.

Ограничения при интерпретации:

1. Не секвенирует некодирующие области: Не выявляет мутации в интронах, регуляторных областях, а также крупные хромосомные перестройки (делеции/дупликации), которые лучше видны при хромосомном микроматричном анализе (ХМА).

2. Сложности биоинформатики: Требует сложного анализа и фильтрации тысяч обнаруженных генетических вариантов. Результат зависит от качества референсной базы данных и вычислительных алгоритмов.

3. Проблема вариантов неясного значения (VUS): Могут быть обнаружены генетические изменения, клиническая значимость которых в настоящее время неизвестна. Это создает сложности для врача и психологическую нагрузку для пациента.

4. Не 100% покрытие экзома: Из-за технических особенностей метода некоторые участки экзонов могут быть «пропущены» или прочитаны с низкой надежностью, что может потребовать целенаправленного подтверждения другими методами (Сангер-секвенирование).

5. Этические и правовые аспекты: Может выявить вторичные (incidental) находки – мутации в генах, не связанные с основным заболеванием, но важные для здоровья (например, предрасположенность к онкологическим или сердечно-сосудистым заболеваниям). Необходимо предварительное информированное согласие пациента на такой поиск.

6. Необходимость анализа пробанда вместе с родителями («трио») для точной интерпретации de novo мутаций и определения фазирования (в цис или транс расположены варианты).